Το Π.Μ.Σ. «Συστήματα Διαχείρισης Ποιότητας & Ασφάλειας Τροφίμων» διατηρεί ισχυρές διαχρονικές συνεργασίες με επιχειρήσεις του κλάδου των τροφίμων, βασισμένες σε αμοιβαίο όφελος. Οι συνεργασίες αυτές περιλαμβάνουν σεμινάρια που πραγματοποιούνται από στελέχη μεγάλων επιχειρήσεων, συχνά στις ίδιες τις εγκαταστάσεις τους, προσφέροντας στους φοιτητές άμεση επαφή με την παραγωγική διαδικασία.
Τα θέματα των διπλωματικών μεταπτυχιακών εργασιών προκύπτουν συχνά σε συνεργασία με τις επιχειρήσεις τροφίμων, επιτρέποντας στους φοιτητές να εστιάσουν σε εφαρμοσμένη έρευνα. Παράλληλα, παρέχεται η δυνατότητα υποχρεωτικής πρακτικής άσκησης των φοιτητών σε συνεργαζόμενες επιχειρήσεις.